服务器的文件系统应该做好安全性的配置，以确保服务器程序(如 apache)没有对文件的编辑和写权限，即是说，对服务器端口程序而言，文件是“只读”的，而文件所有权则被赋予单独的系统用户。
配置示例
例如，大多数系统中，apache的进程由用户"apache“执行，因此这个用户应该具备对Drupal站点内的所有文件的“可读”权限，这个权限可以通过组(group)权限或者其它用户(other)权限赋予。服务器进程用户(如 apache)不应当具备对Drupal站点内文件(及目录)的“写”权限，不过对于 files 目录(上传文件的默认目录)，则可以设置一个例外。
以下是一个安全的文件权限配置示例，其中 lugir 为常规用户，apache 为服务器进程用户，files 目录是指 Drupal 的默认上传目录(即 sites/default/files)，modules 目录在此作为 Drupal 站点中的目录代表，index.php 则作为 Drupal 站点内的文件代表，分别用来展示 Drupal 站点中目录和文件应有的文件权限。通过在命令行下键入 ls -al，可以得到以下输出，以查看文件权限的配置情况。
drwxrwx--- 7 apache lugir 4096 2008-01-18 11:02 files/
drwxr-x--- 32 lugir apache 4096 2008-01-18 11:48 modules/
-rw-r----- 1 lugir apache 873 2007-11-13 15:35 index.php
在上例中，服务器用户(apache)对 files 目录有写权限，任何属于"lugir"组的用户对此目录也有相同的权限，但其它用户则不被允许对此目录有任何交互行为。index.php 文件（在此代表所有文件）可以被"lugir"组的成员进行编辑，apache组的成员则只能读取该文件，其它用户则不允许读写此文件（通常情况下你不希望其它用户读取你的文件，因此目录和文件的后三个权限位被设置为 ---，而不是 r-x）。
以下是一个不安全的权限配置示例：
NOTE: THIS IS AN INSECURE CONFIGURATION
drwxrwx--- 7 apache apache 4096 2008-01-18 11:02 files/
drwxrwx--- 32 lugir apache 4096 2008-05-16 11:48 modules/
-rw-rw-rw- 1 apache apache 873 2007-11-13 15:35 index.php
这个示例允许 apache 用户编辑 index.php 文件(因为示例中，我们以index.php代表所有其它文件，所以可以可能发生的安全问题同等假设到此Drupal站点中的所有其它文件)。将这种配置定为危险配置的原因将在下文中一一说明，如果你正使用这样一个文件权限配置，请立即将其改为第一种版本的形式。
文件权限与数值对应关系
文件的权限使用 rwx 表示，其分别是 read(读)、write(写)、execute(执行)的缩写。
除了用 r,w,x 这三个字母缩写外，还可以用数值来进行权限表示，其中 4 表示 read，2 表示 write，1 表示 execute。
因此文件权限 rwxrwx--- 也可能视作 770
Drupal 站点文件权限修正脚本 - Linux 服务器
（Windows用户请从文末的参考文档中阅读适用于Windows的修正方法）
为了修正Drupal站点中的文件权限问题，可以从Drupal站点根目录执行以下命令，此命令假设服务器进程用户为apache，假设用户 webmaster 为站点管理员，且用户 webmaster 属于 webmaster 组。请确保你在Drupal站点的权限目录运行以下命令，否则可能搞乱你的文件系统权限。
第一部分
[root@localhost]cd /path_to_drupal_installation
[root@localhost]chown -R webmaster:apache .
[root@localhost]find . -type d -exec chmod u=rwx,g=rx,o= {} \;
[root@localhost]find . -type f -exec chmod u=rw,g=r,o= {} \;
第一行命令，将当前路径切换到Drupal站点安装目录；
第二行命令，递归地查看Drupal站点下的目录和文件，并将用户webmaster和组apache设为目录和文件的所有者。不要在托管环境下执行这个命令；
第三行命令，从Drupal站点根目录开始寻找目录和子目录，并执行chmod命令将所有目录的权限更改为所有者(此例为webmaster)“可读”“可写”“可执行”，所有者组(此例为apache组)用户“可读”“可执行”，其它用户无权限；
第四行命令，从Drupal站点根目录开始寻找所有文件，并执行chmod命令将所有文件的权限更改为所有者“可读”“可写”，所有者组“可读”，其它用户无权限
因为 files 目录与其它目录稍有不同，因此还需要执行以下命令为apache组添加“写”权限
第二部分
[root@localhost]cd /path_to_drupal_installation/sites
[root@localhost]find . -type d -name files -exec chmod ug=rwx,o= '{}' \;
[root@localhost]find . -name files -type d -exec find '{}' -type f \; | while read FILE; do chmod ug=rw,o= "$FILE"; done
[root@localhost]find . -name files -type d -exec find '{}' -type d \; | while read DIR; do chmod ug=rwx,o= "$DIR"; done
这些命令在 sites 目录下执行，将 files 目录及其下的所有子目录赋予以下权限：所有者“可读”“可写“”可执行”，所有者组“可读”“可写”“可执行”，其它无权限；为 files 目录下的所有文件赋予以下权限：所有者“可读“”可写“，所有者组”可读“”可写“，其它无权限。
请记得，任何后添加的模块/主题的权限都要做相应的修改，因此最好在安装模块/主题之前先配置好其所在目录的权限。
完整的脚本
以下提供了一个基于以上本文以上准则的权限修复脚本，你可以在每次需要修复Drupal站点的文件权限时使用此脚本。此脚本还添加了目录检测机制，以防止因为路径不正确而造成错误的文件权限修改。
#!/bin/bash
path=${1%/}
user=${2}
group="apache"
help="\nHelp: This script is used to fix permissions of a drupal installation\nyou need to provide the following arguments:\n\t 1) Path to your drupal installation\n\t 2) Username of the user that you want to give files/directories ownership\nNote: \"apache\" (apache default) is assumed as the group the server is belonging to, if this is different you need to modify it manually by editing this script\n\nUsage: (sudo) bash ${0##*/} drupal_path user_name\n"
if [ -z "${path}" ] || [ ! -d "${path}/sites" ] || [ ! -f "${path}/modules/system/system.module" ]; then
echo "Please provide a valid drupal path"
echo -e $help
exit
fi
if [ -z "${user}" ] || [ "`id -un ${user} 2> /dev/null`" != "${user}" ]; then
echo "Please provide a valid user"
echo -e $help
exit
fi
cd $path;
echo -e "Changing ownership of all contents of \"${path}\" :\n user => \"${user}\" \t group => \"${group}\"\n"
chown -R ${user}:${group} .
echo "Changing permissions of all directories inside \"${path}\" to \"750\"..."
find . -type d -exec chmod u=rwx,g=rx,o= {} \;
echo -e "Changing permissions of all files inside \"${path}\" to \"640\"...\n"
find . -type f -exec chmod u=rw,g=r,o= {} \;
cd $path/sites;
echo "Changing permissions of \"files\" directories in \"${path}/sites\" to \"770\"..."
find . -type d -name files -exec chmod ug=rwx,o= '{}' \;
echo "Changing permissions of all files inside all \"files\" directories in \"${path}/sites\" to \"660\"..."
find . -name files -type d -exec find '{}' -type f \; | while read FILE; do chmod ug=rw,o= "$FILE"; done
echo "Changing permissions of all directories inside all \"files\" directories in \"${path}/sites\" to \"770\"..."
find . -name files -type d -exec find '{}' -type d \; | while read DIR; do chmod ug=rwx,o= "$DIR"; done
使用方法：
请将以上代码复制到一个新建的脚本文件中，将其命令为 fix-permission.sh，并通过以下命令执行此脚本，以实现权限修复。
sudo bash fix-permissions.sh your/drupal/path your_user_name
参考文档：http://drupal.org/node/244924